De Lonnekerberg ligt ten noorden van het Twentse dorp Lonneker, in de gemeente Enschede.
Het gebied ligt ten westen van de Oldenzaalsestraat (N733, de weg van Enschede naar Oldenzaal) en ten oosten van de voormalige militaire vliegbasis Twenthe.
De Lonnekerberg vormt het zuidelijk deel van het stuwwalcomplex Enschede-Oldenzaal. Het hoogste punt ligt op ca. 60 meter boven NAP. In feite is de berg dus geen berg maar een heuvel. In het Nedersaksisch is het ‘de Lönnikerbearg’ en daarom wordt het in Twente aangeduid als ‘berg’.